L'équipe de rédaction

Bioinformations est une initiative conjointe de la Société Française de Bioinformatique (SFBI), de l'association des Jeunes Bioinformaticiens de France (JeBiF) et du blog collaboratif francophone Bioinfo-Fr.net. Nous avons souhaité joindre nos forces et proposer aux membres de la communauté francophone des nouvelles en relation avec notre domaine de prédilection : la bioinformatique.

Dans notre équipe de rédaction, nous avons:




Portrait de maria.bernard
Maria Bernard (SFBI)
Affiliation: INRAE Jouy en Josas, plateforme SIGENAE et équipe GIBBS

Quelques mots me concernant...

Après une formation 100% bioinfo (DUT Aurillac puis IUP Evry), je commence ma vie professionnelle sur la plateforme de transcriptomique de l'ENS à Paris, j'y découvre les NGS via le RNASeq. Puis j'intègre le Génoscope à Evry pour travailler sur l'assemblage de grand génome eucaryote et finalement j'intègre en 2012 INRAE à Jouy en Josas pour accompagner les chercheurs de génétique animale dans l'analyse de leur données de séquences. Je travaille principalement dans la recherche de variants via différents protocoles, ainsi qu'en métagénomique via le développement d'une suite d'outils FROGS (aller voir !!). En décembre (2020) je commence une nouvelle aventure en démarrant un projet de thèse sur le microbiote de poule.

Je suis régulièrement en relation avec les ingénieurs qui travaillent pour l'IFB, notamment via l'animation de la formation en bioinfo à Roscoff. Depuis JOBIM 2020 j'ai intégré le bureau de la SFBI pour contribuer à l'animation de notre belle communauté bioinformaticienne.



Virginie Bernard (SFBI)
Affiliation: Plateforme NGS, Institut Curie

Quelques mots me concernant...

Bonjour,

Après une thèse ayant pour objectifde prédire des éléments régulateurs de l'expression des gènes, je suis partie pour 2 ans de postdoc à Vancouver au Canada où j'ai travaillé sur la mise au point de pipelines NGS pour la prédiction de mutations dans diverses maladies génétiques. Depuis 2012, je suis revenue en France où je travaille à l'institut Curie sur la plateforme NGS en tant que responsable bioinfo.

J'ai été impliquée dans la création de JeBiF et suis restée dans le bureau jusqu'en 2011. Depuis 2013, je suis membre du bureau de la SFBI. Aujourd'hui, je reprend le flambeau de Magali en coordinant les groupes de travail pour les Bioinformations.

A bientôt!

Virginie



Portrait de Rayna
Geekus Biologicus (Bioinfo-fr)
Affiliation: sphère bioinformatique francophone

Quelques mots me concernant...

Nous sommes une quarantaine de contributeurs qui, à travers leur passion commune, partagent leur vision de la bioinformatique (d'aujourd'hui). Bioinfo-Fr.net est le premier blog francophone et collaboratif où tous les bioinformaticiens sont les bienvenus. Nous apportons notre savoir et expérience dans le domaine pour la rédaction des bioinformations.


Pour nous contacter, écrivez-nous !



Portrait de sarah
Sarah Djebali Quelen (SFBI)
Affiliation: INSERM U1220

Quelques mots me concernant...

Informaticienne de formation, je me suis orientée vers la bioinformatique par un doctorat sur l’identification des gènes dans les génomes aux laboratoires IBENS et IBISC (2002-2006).

Après un long séjour postdoctoral (2006-2015) au centre de régulation génomique (CRG) de Barcrelone, où j’ai fortement contribué aux projets ENCODE et mouse ENCODE d’annotation fonctionnelle des génomes humain et murin (transcriptomique, régulation), j’ai rejoint l’INRA de Toulouse depuis 2015 où je poursuis ces efforts d’annotation sur les animaux terrestres d’élevage (projet FR-AgENCODE).
 
En novembre 2019, j'ai été recrutée en tant que chercheur INSERM au laboratoire IRSD de Toulouse.
 
Membre du bureau de la SFBI depuis 2018, je suis intéressée par la vulgarisation de la bioinformatique en France, et pour cette raison ai souhaité apporter mon soutien aux bioinformations.
image
 
 

 



Portrait de Anna-Sophie
Anna-Sophie Fiston-Lavier (SFBI)
Affiliation:

Quelques mots me concernant...


Julien Fumey (SFBI)
Affiliation:

Quelques mots me concernant...


Portrait de Valentin Guignon
Valentin Guignon (SFBI)
Affiliation: Bioversity International (Montpellier)

Quelques mots me concernant...

Impliqué dans de nombreuses activités, je suis ici surtout en tant qu'admin, webmaster, support technique et éventuellement rédacteur. N'hésitez pas à me contacter via le lien contact (en haut)! ;-) Au plaisir!



RSG France - JeBiF Jeunes Bioinformaticiens de France (JeBiF)
Affiliation:

Quelques mots me concernant...

L'Association des Jeunes Bioinformaticiens de France a pour vocation de structurer la jeune communauté bioinformatique.

https://jebif.fr/

 



Portrait de Suzanne Lauriou
Suzanne Lauriou (Autre)
Affiliation: IFB

Quelques mots me concernant...

Diplômée d'un master de Communication, j'intègre l'Institut Français de Bioinformatique (IFB) en tant que Chargée de Communication à la mi 2020. Impliquée autant dans la commmunication interne qu'externe, je suis ravie de pouvoir ici contribuer à la rédaction d'actualités dédiées à la communauté française des scientifiques des sciences de la vie. 



Portrait de Sophie Schbath
Sophie Schbath (SFBI)
Affiliation: INRA, Unité Mathématique, Informatique et Génome (MIG), Jouy-en-Josas

Quelques mots me concernant...

Je suis statisticienne de formation et j'ai eu la chance de démarrer ma carrière de chercheur dans l'univers de la bioinformatique et plus particulièrement l'analyse des séquences génomiques et les statistiques de motifs d'ADN. Je préside la SFBI depuis février 2010 et je participe à la rédaction des articles "À ne pas manquer " et "À l'affiche" pour les Bioinformations.



Morgane Thomas-Chollier (SFBI)
Affiliation: Ecole normale supérieure, Paris

Quelques mots me concernant...

Biologiste de formation mais attirée par l'informatique, j'ai franchi le pas vers la bioinfo au cours de mon master, suivi d'une thèse à Bruxelles, puis d'un post-doc à Berlin, avant de revenir en France en 2012 en tant qu'enseignant-chercheur. Je m'interesse à l'analyse des régions cis-régulatrices, et le processing de données NGS. Depuis septembre 2015, je suis vice-présidente de la SFBI, et participe à la relecture des articles pour les bioinformations.



Hélène Touzet (Autre)
Affiliation: Université de Lille

Quelques mots me concernant...