Bioinformatique française et Covid-19
L'émergence du virus SARS-Cov2 responsable de la maladie Covid-19 dans le monde a suscité de très nombreuses initiatives de la part de la communauté bioinformatique française.
On peut par exemple citer :
- un consortium français pluridisciplinaire de criblage virtuel de 1,5 milliard de molécules pouvant potentiellement inhiber le virus
- la mobilisation de toutes les unités et entités du département de biologie computationnelle de l'institut Pasteur
- la mise à disposition par l'IFB de ressources de calcul pour la recherche contre la Covid-19
- l'implication de chercheurs français dans le projet international en bioinformatique Covid disease map, pour la construction d'une carte d'intéractions virus-corps humain
C'est aussi en France qu'a été créé le programme phyML pour reconstruire la phylogénie des virus et leur chaîne de transmission, très utilisé dans le cadre de la Covid-19, ainsi qu'une modélisation de l'épidémie mondialement reconnue.
La communauté française a aussi cherché à vulgariser des sujets aussi complexes que l'assemblage de génomes de virus à partir de données de séquençage, à centraliser et formaliser les ressources ou encore à lister des liens utiles pour la recherche contre la Covid-19.
D'autres initiatives, scientifiques mais aussi sociales et matérielles, ont été entreprises par des membres de notre communauté. Au sein du bureau de la SFBI par exemple, on a ressorti les machines à coudre et fabriqué des dizaines de masques en tissus, donnés entre autres aux membres des Plans de Continuité d'Activité de nos instituts.