Bioinformations 9

Aux dernières nouvelles...

A la découverte du portail "bioinfo" de l'Inra...

Nous espérons que vous avez passé d'excellentes fêtes de fin d'année, fin prêts pour une nouvelle saison des Bioinformations ?

Nous démarrons par cette initiative d'un collègue bioinformaticien. Avez-vous visité ce site de petites annonces dédiées au monde académique ? Vous y trouverez notamment des offres de logements temporaires (justement ... on en parlait dans les dernières Bioinformations n°8 dans la rubrique "emplois/stages" mais nous n'avions pas de solution...). L'accès au site nécessite d'utiliser une adresse professionnelle d'un labo/institut répertorié.

Voici une autre initiative à partager avec vous. L'Inra s'est doté d'un portail des sciences du numérique et de la modélisation, et nous pensons que sa rubrique bioinformatique pourrait vous intéresser, même si vous n'êtes pas de cet institut. Elle regroupe en effet  les activités de la communauté des bioinformaticiens de l'Inra (chercheurs et ingénieurs) mais aussi les mathématiciens, les statisticiens, les informaticiens et les biologistes travaillant sur des objets et données biologiques (données 'omiques', biologie à haut-débit, etc...). Vous y trouverez entre autres (1)  Personnes et organisations (Equipes de recherches, Ingénierie et réseaux métiers informatiques, Plateformes), (2) Recherches (Publications récentes, Faits marquants, Projets, Réseaux et groupes de travail), (3)  Productions et services (Cours, Formations, Logiciels), (4)  Partenariats (Agreenium, France, International) et (5) Emplois et stages (CDDs, Concours titulaires, Stages, Thèses et Postdoc).

Aussi, le contrat qui fait polémique entre l'éditeur Elsevier et le Ministère de la Recherche concernant l'accès à nos publications peut-être lu ici.

Enfin, toutes nos félicitations vont à Claudine Médigue (Génoscope, Evry) qui vient de recevoir la médaille Louis Pasteur pour ses travaux "mieux comprendre les génomes bactériens et leur métabolisme".

 

Formations/emplois

Recherche d'un travail en bioinformatique et importance de la multidisciplinarité

On passe tous par cette étape cruciale dans notre vie professionnelle au moins une fois : la recherche d'un emploi. Avant toute chose il faut cibler ses capacités et ses attentes puis essayer de poser tout cela à plat sur un CV.

Notre métier, un peu à la frontière entre deux mondes (voire plus parfois), nous oblige à adopter quelques règles indispensables pour ne pas passer à la trappe au premier coup d'oeil.

Comment rédiger un CV qui attisera la curiosité des recruteurs ? Faut-il faire une lettre de motivation et si oui de quoi doit-elle avoir l'air ? Et si on décroche un entretien, à quoi doit-on s'attendre quand on est (ou veut devenir) un bioinformaticien ?

La plupart de ces réponses a été déposée dans cet article : "Le recrutement en bioinfo" écrit par un bioinformaticien, recruteur à ses heures. En suivant ces bons conseils vous décrocherez peut-être le poste de vos rêves parmi la liste des offres disponibles sur la page emploi du site de  la SFBI !

Enfin, si vous hésitiez encore à vous lancer dans le grand bain qu'est la Bioinformatique, nous vous conseillons vivement de jeter un oeil sur ce billet qui résume assez bien la vision des choses actuelle de notre discipline multidisciplinaire.

Alors bonne lecture à vous !

À l'affiche...

Cet hiver 2015 !

Quelques évènements à ne pas manquer !
Ceux qui auront lieu dans les prochains mois en France :
  • ALPHY 2015, du 11 au 12 mars à Montpellier. Il s'agit d'une réunion annuelle financée par le GDR BIM autour des mots clé "phylogénie", "génomique évolutive" et "bioinformatique". Les étudiants et jeunes chercheurs sont notamment encouragés à soumettre un résumé. Ils trouveront en ALPHY un contexte peu formel et propice à la discussion, tout en permettant un tour d'horizon des développements récents et des axes émergents sur ces thématiques en France.
  • Perspectives in Environmental and Systems Biology, du 13 au 15 avril à Grenoble. 
  • 43rd European Mathematical Genetics Meeting (EMGM'15), du 16 au 17 avril à Brest. Une opportunité de découvrir et discuter les dernières nouveautés en matière de génétique statistique.
Mais aussi à l'étranger  :
À noter aussi cette école d'été de l'université d'Angers consacrée à la bioinformatique qui aura lieu du 29 juin au 10 juillet 2015 et pour laquelle la date limite d'inscription est le 15 avril. Accessible à partir du niveau L3 jusqu’au post-doc, ce programme est destiné aux étudiants en biologie, médecine, pharmacie, diplôme d’ingénieur … qui souhaitent ouvrir leur champ de compétences à la bioinformatique. Aucun pré-requis en informatique ou en programmation n’est nécessaire. Une session de mise à niveau est prévue au début de l’école.
Et plein d'autres événements encore sur la page consacrée du site de la SFBI ;-)

J'ai lu

Les petites astuces de la nouvelle année

2015 est bien là et avec lui son lot d'astuces.
Nous allons vous aiguiller vers deux articles qui pourraient vous faire gagner un temps précieux dans vos futures analyses.

Le premier est un billet sur Numba, qui permettra aisément d'améliorer le temps d'exécution de vos programmes python les plus lents. L'approche est très facile et ne demande plus qu'à être appliquée. Foncez !

Le second concernera et ravira les furieux de la fouille de données. Car en effet la découverte d'Open Refine vous fera aimer la recherche d'informations textuelles. L'essayer, c'est l'adopter !

Alors à vous de jouer maintenant !

Exclusivité!

JeBiF Pub

Nous vous avions présenté l'association JeBiF et son travail il y a quelques mois. Aujourd'hui, nous vous parlons plus spécifiquement des JeBiF Pub. Quesako ? Tout est expliqué ici, mais en résumé, c'est l'occasion de se rencontrer et d'échanger sur des thématiques pouvant être liées au travail... ou pas. 

Dans le cadre des JeBiF pub, afin de bien commencer l'année, l'association vous invite à venir tirer les rois le 16 Janvier. Où ça ? Au bar L'imprévu Café (métro Châtelet) à Paris à partir de 19h00. Plus d'informations ici. Afin d'avoir assez de galettes pour tout le monde, merci de vous inscrire via ce formulaire!

A lavenir, l'association JeBiF souhaiterait étendre ces manifestations à d'autres villes de France. Si vous êtes intéressé(e), n'hésitez pas à les contacter

Cet article est l'occasion de vous présenter le nouveau bureau JeBiF :

  • Julien Fumey (doctorant), président
  • Romy Chen-Min-Tao (ingénieur d'études), vice-présidente
  • Sylvain Léonard (ingénieur d'études), trésorier
  • Emmanuelle Lastrucci (ingénieur d'études), secrétaire.
  • Sans oublier tous les membres du conseil d'administration !

Merci à eux pour les actions menées tout au long de l'année !