Réseaux, workflow, visualisation et bien plus encore à l'intérieur !

C'est un printemps riche en découvertes que nous vous proposons ! De quoi occuper vos longues soirées.

On commence au pays des workflow avec un cousin de snakemake, j'ai nommé Nextflow. Vous découvrirez entre autre dans l'article un retour d'expérience en bioinfo comme on les aime.

On enchaine avec la visualisation ! Et on va commencer par de la visualisation de réseaux. Parce qu'on en parle souvent, mais savez-vous vraiment quel(s) outil(s) utiliser ? Dans le doute, on vous aide donc à y voir plus clair.

Et les cartes de contacts chromosomiques, ça vous parle ? Vaste domaine, et qui méritait son article découverte. N'en demander plus, le voici !

Popopo, pas de jaloux ! On parle de chromosomes plus haut, on va donc laisser un peu de place aux gènes. Apprenez à utiliser genometools, un outil qui vous permettra de visualiser les gènes sur des génomes de références.

Vous pouvez aussi apprendre à récupérer vos informations biologiques d'intérêt de manière automatique ! Ça vous tente n'est-ce pas ? C'est par ici.

Enfin, pour faire tout ça, rien de mieux qu'une machine virtuelle ou qu'un bon vieux Docker n'est-ce pas ? Eh bien non, nous on a trouvé encore un autre candidat : il s'agit de LXD, et à ce qu'il parait c'est assez magique. A vous de voir !

Bonne découvertes :)