Bioinformations 23

Présentation

Nouveau bureau de la SFBI

Comme chaque année, une partie du bureau de la SFBI a été renouvelée lors de l’AG qui s’est tenue à JOBIM, grâce au vote des adhérents. On vous dévoile donc le nouveau bureau :

Pour la dernière année, Morgane Thomas-Chollier (ENS, Paris) poursuit la présidence avec Hélène Chiapello (INRA, Jouy-en-Josas) à la vice présidence. Elles vont poursuivre les actions autour de l’organisation des futurs JOBIM avec Julien Fumey (Pasteur, Paris), ancien président des JeBiF, qui continue d’entretenir un lien privilégié entre les deux associations. Une nouvelle édition de REBIF est aussi prévue pour le printemps 2020. Marc Deloger (INSERM U900 Institut Curie, Paris) poursuit la gestion de la trésorerie.

Alexandra Louis (CNRS, IBENS, Paris), déjà modératrice de la liste de diffusion bioinfo, poursuit son travail de validation des comptes et emplois ainsi que l'insertion d'évènements et colloques. Samuel Mondy (INRA, Dijon) gère les bourses de voyage, et Sarah Djebali (INSERM U1220, Toulouse) co-écrit les bioinformations avec la SFBI et ses partenaires (JeBiF et bioinfo-fr.net) et met à jour la page des thèses et HDR sur le site web.

Bienvenue à Matthias Zytnicki (INRA, Toulouse) et Erwan Corre (CNRS, Roscoff) qui vont contribuer aux actions de l'année. Matthias s'investit entre autre dans l’amélioration du site web et la mise à jour du listing des équipes et plateformes. Erwan devient le point de contact pour les actions conjointes avec l’Institut Français de Bioinformatique.

Cette année, nous aurons aussi le soutien de Virginie Bernard pour les bioinformations, de Valentin Guignon et Yannick Boursin pour le site web, de Laurent Mouchard pour la modération de la liste bioinfo, et de Sophie Schbath pour la validation des offres d’emploi et des comptes.

Le prochain renouvellement du bureau aura lieu lors de JOBIM à Montpellier. Pour voter il suffit d'être adhérent à la SFBI au 31 mai 2020.

Exclusivité!

La check-list de rentrée

On entend au loin 4 petits administrateurs de bioinfo-fr.net tapoter sur leurs claviers :
- Alors cette rentrée ? On en est où ?
- On devrait être prêts !
- Blog relancé pour la rentrée 2019/2020 ?
- Check
- Chan IRC #bioinfo-fr prêt en cas de question / infos ?
- Check
- Nouveaux articles en préparation ?
- Check
- Auteurs / Contributeurs ?
- On n'en a jamais assez !
- Surprise ?
- Chhhhhhhhhhut ! Faut pas en parler de suite !
 
Votre équipe d'admins accompagnée de ses auteurs revient toujours plus motivée en cette nouvelle année scolaire ! Et ils ont mis cet été à profit pour vous préparer une petite surprise bio-informatique d'ici la fin de l'année. Suivez l'actualité du blog régulièrement pour en savoir plus !
 
Pour vous faire patienter entre temps, on vous prévoit une petite salve d'articles sur de l'épigénétique, de la co-expression, de l'omic dans tout ses états, et tout autre sujet qu'il vous plaira de venir développer chez nous ;)
 
D'ailleurs, si après avoir lu l'intérêt des communautés scientifiques cela vous tente de venir rejoindre nos rangs, n'hésitez plus : on a besoin de vous !

Présentation

Le nouveau bureau de JeBiF

Le 20 septembre dernier, l'association des Jeunes Bioinformaticiens de France (RSG France - JeBiF) a tenu son Assemblée Générale Ordinaire annuelle, l'occasion de renouveler légèrement son Conseil d'Administration. Le bureau est également un peu changé, Florence laissant la main à Victor pour la présidence. 
 
Le nouveau Conseil d'Administration est maintenant composé de :
  • Victor Grenzinger, Président
  • Florence Jornod, Vice-présidente
  • Slim El Khiari, Trésorier
  • Xavier Bussell, Secrétaire
  • Julien Fumey
  • Mathias Galati    
  • Athénaïs Vaginay
Nous sommes à votre disposition pour toute question à l’adresse contact at jebif.fr =) 

À l'affiche...

SFBI et JOBIM : les noces de cristal en 2020

Le mariage de la SFBI avec JOBIM dure depuis 15 ans. Mais au fait, quel est le rôle de la SFBI dans l’organisation de JOBIM ?

Pour ceux qui étaient à l’édition nantaise en juillet dernier, vous avez pu découvrir le stand SFBI (et les jolis t-shirts qui se sont vendus comme des p'tits pains, merci !), mais la SFBI a un rôle bien plus important pour JOBIM, qui est l'une de ses principales missions. On vous dit tout ici.

Formations/emplois

Entre retour de vacances et formation

L'été est malheureusement bien fini, mais de belles histoires s'y sont écrites. Laissez-nous vous conter celle de la conférence ISMB/ECCB 2019 à Bâle, une histoire courte mais intense de 5 jours en terres bio-informatiques. Pour ce faire, on s'est aidé d'une machette moderne, à savoir le live tweet ! Si vous n'êtes pas encore familier avec cette pratique, on vous apprend comment et pour quoi faire, et surtout par quels moyens l'exploiter au mieux (un indice, on a fait du R ;D).
 
Si vous êtes des bio-informaticiens d'action que les comptes rendus intéressent peu, on vous propose de recommencer cette année de code avec une bonne pratique trop peu appliquée : les tests (fonctionnels, intégration, et unitaire)  ! Ou comment prévenir des bugs, voire gagner du temps de dev. Et comme robustesse se marie bien avec reproductibilité, on vous propose de poursuivre votre lecture avec la réalisation de pipelines Snakemake à l'épreuvre d'une plateforme de bioinfo !

Aux dernières nouvelles...

JeBiF à la Fête de la Science 2019

Lors de cette Fête de la Science, JeBiF a proposé au public de la Cité des Sciences et du Village des Sciences de Sorbonne Université de monter à bord du voilier scientifique "Ada Lovelace" pour une grande aventure sur l'Océan Pacifique. Malheureusement, lors de cette traversée, une terrible tempête a entraîné le naufrage de l'équipage sur une île inconnue, que le Capitaine Nounours, la mascotte de JeBIF, a décidé de nommer "Île 454" avant de partir l'explorer.


À travers 3 ateliers, que nous détaillons dans notre article, le public a pu découvrir différents aspects de la bioinformatique, et les petits explorateurs bioinfos qui sont passés sur notre stand ont tous réussi à merveille leur mission ! D'après les relevés réalisés lors de cette mission, nous prévoyons qu'une invasion de Zombinours pourrait avoir lieu l'an prochain aux alentours de début octobre.

Plus d’infos à venir sur notre site web !

Divers

Clôture budgétaire, pensez adhésion SFBI

La fin de l'année approche et il vous reste des crédits ?

Au lieu de commander un énième disque dur, pourquoi ne pas prendre une 

adhésion de personne morale à la Société Française de Bioinformatique 

(SFBI) pour votre laboratoire/Équipe de Recherche/Plateforme ?

Coût : 300 euros. Nous acceptons les adhésions par anticipation pour 2020.

Avantages :

  • Mise en avant de votre logo via un bandeau défilant sur la page d'accueil de notre site web

  • 3 personnes physiques adhérentes

  • En plus des ces 3 personnes adhérentes, tarif préférentiel pour une inscription à JOBIM pour 2 doctorant(e)s de l'équipe adhérente (sans adhésion à titre individuel)

  • Candidature aux bourses SFBI pour toute l’équipe, sans adhésion à titre individuel

  • Et surtout un soutien important à nos actions (bourses de voyage pour JOBIM, bourses de voyage doctorants, prix jeunes scientifiques à JOBIM, MetBIF, REBIF, Meet-U, etc).

Toutes les infos ici.

Pour adhérer : contactez par email notre trésorier Marc Deloger (marc.deloger at curie.fr)

Aux dernières nouvelles...

JeBiF@JOBIM 2019

Cette année encore, JeBiF vous a donné rendez-vous les 1er et 2 juillet pour son workshop annuel, pré-JOBIM.

Nous avons eu le plaisir de recevoir Morgan Magnin lors d’une Keynote, intitulée « Comprendre la dynamique des systèmes biologiques grâce à la modélisation hybride ». À la suite de cette dernière, des participants au Workshop ont réalisé une présentation flash de leurs posters. Enfin, un moment convivial d’ice-breaking a été réalisé, et s’est poursuivi dans un bar à jeux.

Lors du deuxième jour, nous avons eu le plaisir d’accueillir Cyprien Guérin, Andrée Delahaye, et Stéphane Téletchéa, afin de discuter autour d’une table ronde sur les carrières dans le domaine de la bioinformatique. Cette traditionnelle table ronde a clôturé notre workshop de cette année.

Nous vous attendons nombreux l’an prochain, toujours avec plaisir ;)

À l'affiche...

Au programme cet automne

Beaucoup de rendez vous nous attendent pour les mois à venir, en France :

Mais aussi à l'étranger :

Pour ne pas louper une formation ou un colloque, pensez à suivre les informations sur le site de la SFBI !