Bioinformations 19

Aux dernières nouvelles...

En direct de la SFBI

Ce début d’année est déjà bien rempli pour la SFBI !

Nous réitérons les bourses de voyages destinées aux doctorants pour présenter leurs travaux à l’étranger. N'hésitez pas à candidater tout au long de l'année (15 avril - 30 septembre en 2018), les bourses étant attribuées tant que le montant annuel le permet. 
Nous organisons deux journées de travail les 31 mai et 1er juin : MetBif (rencontre autours des Métiers de la Bioinformatique) et REBIF (Réunion sur l'Enseignement de la Bioinformatique en France). Pour préparer MetBIF, nous avons besoin de vous ! Merci de nous faire part de votre expérience professionnelle en répondant à ce questionnaireRendez-vous à JOBIM pour les conclusions de ces deux journées !

Comme tous les ans, 1/3 du bureau va être renouvelé (soit 3 membres). Vous souhaitez contribuer à la communauté bioinformatique ? Nous aider à mener à bien nos actions ? Contactez-nous avant le 31 mai. 
Rappel : pour se présenter ou pour voter, il faut être adhérent avant cette date.

Enfin, nous avons soutenus les unités d’enseignement Meet-U et Montpellier Omics Days. Maintenant, nous planchons activement sur le nouveau site web…bientôt, promis !
 

Divers

JeBiF souffle ses 10 bougies

Cette année est une année toute particulière pour JeBiF. En effet l'association fête ses dix ans !

Pour l'occasion, nous allons organiser divers évènements afin de marquer le coup ! Un évènement lors de notre workshop à JOBIM (informations et inscriptions sur notre site), des JeBiF Pubs synchronisés partout en France, un gros gâteau, et plein d'autres choses à découvrir tout au long de l'année !

En attendant d'en savoir plus, vous avez d'ailleurs pu remarquer le changement de logo sur nos différents canaux de communication.

En tout cas merci à vous tous d'avoir permis à JeBiF d'exister depuis dix ans, et on espère de lui permettre de vivre encore de longues années.

À bientôt pour fêter ensemble cet anniversaire !

Exclusivité!

Bonjour, c'est pour une enquête !

Si vous êtes déjà abonné au flux RSS de bioinfo-fr.net, à la liste bioinfo SFBI ou que vous êtes un tweetos à la pointe des nouvelles autour de la bioinfo, vous l'aviez déjà vu passer : les Geekus biologicus ont mis en place une enquête anonyme axée autour du quotidien d'un(e) professionnel(le) en bioinformatique. C'est ici que ça se passe et c'est ouvert jusqu'au 30 avril ! N'hésitez surtout pas à partager à vos collègues moins connectés que vous :).

Une retranscription et interprétation de la totalité des résultats sera proposée avant juillet 2018 sur bioinfo-fr.net.

Formations/emplois

BIG DAY

A Rennes, le 17 novembre 2017 a eu lieu la quatrième édition du BIGDAY, journée autour de la bioinformatique organisée par le Master de Bioinformatique de l’Université de Rennes 1. Cette journée s’est articulée autour de discussions scientifiques et de retours d’expérience d’étudiants ou d’anciens étudiants du Master. Les étudiants de Master 1 ont également présenté des posters scientifiques portant sur les stages réalisés par leurs aînés. La diversité des présentations proposées a permis aux étudiants de réfléchir à leur insertion professionnelle dans le domaine de la bioinformatique mais également d’avoir un aperçu de différents travaux actuels dans ce domaine. La journée a été clôturée par la conférence de la marraine de la promotion 2015 - 2017 du Master, le Pr. Sylvie Ricard Blum de l’Université de Lyon 1 qui a pu présenter son parcours et son travail de recherche sur les réseaux biologiques avant de féliciter les étudiants  lors de la remise des diplômes.
 
La qualité des conférences scientifiques, la présence d’anciens étudiants et l’investissement des étudiants pour son organisation ont fait du BIG DAY 2017 une journée pertinente et conviviale pour la bioinformatique sur la place rennaise.
 
Les étudiants vous donnent donc rendez-vous en Novembre prochain pour la cinquième édition du BIG DAY !
 
Pour plus d’informations sur les activités et projets des étudiants du Master de bioinformatique de Rennes 1.

À l'affiche...

JOBIM 2018

Rendez-vous incontournable du début de l’été, les Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM) auront cette année un petit goût de Pastis, sous le soleil de Marseille ! 

Du 3 au 6 juillet, venez au palais du Pharo rencontrer la communauté bioinformatique et présenter vos travaux et services.
JOBIM est l'occasion idéale pour les étudiants et post-doctorants de présenter leur premier poster ou présentation orale dans une atmosphère bienveillante. Et de gagner un des prix SFBI pour le meilleur poster ou la meilleure présentation orale ! Sans oublier le rendez-vous Jebif juste avant (2 au 3 juillet).

La SFBI offre des bourses de voyage pour venir de l’étranger ou soutenir la venue d’ingénieurs titulaires en France.

Nouveautés : 
Trois catégories de posters pour mettre en valeur le travail de l’ensemble de la communauté :
• Général: présentation des résultats scientifiques
• Activité de service et plateforme
• Réseaux thématiques, groupes de travail et associations

Pour bénéficier du tarif préférentiel à JOBIM, n’oubliez pas de prendre avant votre adhésion à la SFBI, car il n’y a pas d’inscription couplées à l’adhésion cette année.

Pour soumettre et s’inscrire c'est ici.

Formations/emplois

Bons conseils et petites astuces

Les stages des Master 2 en bioinformatique sont en cours. Vous voilà arrivés dans votre équipe d'accueil depuis 1 ou 2 mois (ou peut-être plus), quoi de mieux pour vous que de lire quelques conseils ? En tout cas pas de soucis : tout va bien se passer si vous lisez avec attention ce guide du bon stagiaire.

Et après ce stage ? Il faudra penser assez rapidement à chercher un poste pour la suite de votre prometteuse carrière ! On vous apprend comment rédiger votre lettre de motivation en LaTeX, s'il vous plaît ! Si par le plus grand des hasards vous tenez une liste de vos qualités/défauts dans un CSV et que vous vous demandiez comment inclure ça quelque part dans votre document LaTeX c'est clairement votre jour de chance et la réponse se trouve dans ce billet.

Mais vous vous demandez comment s'y prendre pour tendre vers cette prometteuse carrière ? Rien de plus simple : adopter les bonnes pratiques !

Vous en trouverez de partout : par exemple pour les "R users", pourquoi ne pas jeter un oeil à Rmarkdown afin de permettre une reproductibilité maximale de vos projets ?
Mais on peut même descendre jusqu'au niveau d'une bibliothèque, comme par exemple avec cette astuce pour le matplotlibrc !
Ou alors vous êtes plus traitement de données en Python, et là votre meilleur ami doit (devra) être Pandas. A vous de voir ici si vous le connaissez aussi bien que vous le pensiez !

On ne pourra pas dire qu'il n'y en aura pas eu pour tout le monde !!! :)

Formations/emplois

Retour sur les TAPs

Au mois de février, JeBiF a eu à nouveau l'occasion d'animer des ateliers autour de l'informatique dans le cadre de TAPS (Temps d'Activités Périscolaires) pour des enfants de CM1 et CM2 ( 9-10 ans). L'objectif des 4 séances était de les amener à une initiation du langage HTML.
 
Les deux premières séances ont permis de faire le point sur ce qu'est un ordinateur, quels sont ses composants et qui fait quoi, ainsi que de montrer aux enfants comment formater un texte sur OpenOffice Writer.
 
La troisième séance a eu pour objectif de sensibiliser les enfants à l'utilisation d'internet. nous avons pu leur parler librement de protection de données, d'usurpation d'identité, de harcèlement, ainsi que de fausses informations.
 
Enfin, lors de la dernière séance, les enfants ont pu s'initier au langage HTML. Après une brève introduction sur les notions de navigateur, ils ont eu à mettre en forme une recette de cuisine. Ils ont pu ainsi voir la notion de balise.
 
Si vous souhaitez en savoir plus, n'hésitez pas à vous rendre sur notre site internet, nous mettrons à disposition le détail des séances.
 

Technologies

Pêle-mêle de découvertes printanières

A l'heure du big data il est essentiel de savoir où chercher LA bonne donnée. Qui n'a jamais pesté devant son écran en se demandant où diable pouvaient se trouver telles ou telles données de séquençage ? Bonne nouvelle : cela ne devrait plus vous arriver après avoir lu cet article.

Mais au fait, êtes vous sûr(e) de bien maitriser les bases du côté biologie ? Si je vous dit "site d'initiation de la transcription" ? Allez, c'est pas grave, on est là aussi pour vous faire des petits rappels sympa. Pour le coup, c'est superbement expliqué dans cet article et ça n'attend plus que vos yeux :)

Et si vous alliez même jusqu'à découvrir ce que faisait l'équipe à côté de la vôtre ? La Science c'est du partage et de la découverte avant tout. Voilà vôtre dose autour de la célèbre chromatine. Bonne exploration et n'hésitez pas à proposer vôtre version à vous !

Enfin pour faire passer un message à ses collègues, il peut être important de faire appel à des schémas ! Quoi de mieux pour ça que d'apprendre à se servir d'un logiciel libre qui nous permettrait de réaliser des éléments biologiques en moins de 10 minutes ? Vous ne nous croyez pas ? Eh bien libre à vous d'aller jeter un oeil par là !

Bonnes lectures de printemps à tous :)

À l'affiche...

Ce printemps (et début d'été) 2018

Avec l'arrivée du beau temps (si si!!) vous allez pouvoir en profiter pour aller en conférences en France :
Mais aussi à l'étranger :
Bien des occasions de discuter science ... Profitez en! Vous trouverez tous les détails sur notre page des prochains colloques.