Bioinformations 13

Aux dernières nouvelles...

Du tout nouveau, du tout beau

Quelques informations rien que pour vous (ou presque!!) 

Nous vous en avions parlé ... le SFBI va aider des doctorants à participer à des conférences internationales en bioinformatique via plusieurs bourses de voyage. L'appel d'offre de janvier 2016 est clôturé depuis le 1er mars, mais il est toujours possible de postuler! Il reste des bourses disponibles! Nous invitons donc les doctorants intéressés à soumettre un dossier!

En ce début d'année 2016, une nouvelle équipe a pris la direction du GdR de Bioinformatique Moléculaire (BIM). Hélène Touzet et Céline Brochier remplacent Eric Rivals et Eduardo Rocha qui ont été appelés à d'autres fonctions. Stéphane Robin, quant à lui, reste impliqué dans la direction du GdR BIM. Surveillez bien les appels pour les financements d'animations! Le GdR soutient de nombreuses manifestations.

En ce début de mois de mars, à vos claviers. Pensez à l'ouverture des soumissions à JOBIM 2016  et ne laissez pas passer la date du 15 avril, sinon, RDV en 2017...

Enfin, nous souhaitons un très bon anniversaire à bioinfo-fr.net ! Quatre ans? Ou bien un an? A vous d'en débattre si vous le souhaitez, mais ce qui compte c'est que le site soit toujours aussi riche et diversifié!

Présentation

TOBi or not TOBi : that's not a question !

TOBi n'est pas le nom d'un nouveau robot dans Star Wars, ce n'est pas non plus le héros du prochain Pixar, cela désigne tout simplement la nouvelle formule proposée par l'association JeBiF pour remplacer les JeBiF pubs à Paris. Les Tables Ouvertes Bioinfo sont donc le nouveau rendez-vous mensuel des bioinformaticiens en région parisienne.


Pas d'inquiétude : il y est toujours question de se retrouver dans une ambiance amicale, de faire des rencontres, et d'échanger sur la bioinformatique autour d'un verre ! Mais ce nouveau format comprend la présence d'un invité pour discuter sur le sujet de son choix et échanger avec le public.


C'est Christophe Malabat (co-directeur du HUB à l'Institut Pasteur) qui a essuyé les plâtres inauguré la première Table Ouverte Bioinfo le 14 janvier, au café Six. Après une présentation de son parcours, il a parlé plus longuement du hub de bioinformatique et biostatistiques, de son organisation, et de son avenir. L'expérience a été enrichissante, par les explications et les conseils fournis, tout en restant dans une atmosphère joviale et décontractée. Et les personnes présentes ont pu discuter et boire comme d'habitude pour le reste de la soirée.


Alexandre de Brevern (directeur de recherche à l'INSERM) était l'invité de la deuxième TOBi, le 11 février, toujours au café Six. Nous avons eu cette fois des explications sur les carrières possibles dans les organismes de recherche publiques et à l'université. Le débat a également été lancé sur la génomique et la bioinformatique structurale. Le plus important à retenir : faites ce qui vous plait :-) tant sur les sujets de recherche que pour votre carrière.


Au mois de mars, ce sera Sophie Schbath, directrice de recherche à l'INRA et présidente de la SFBI, qui se prêtera au jeu. Rendez-vous le 10 mars au café Six ! Plus d'informations sur notre site web : https://jebif.fr/fr/events/jebif-pub-paris-2016-03-10/


Et n'oubliez pas, les JeBiF Pub continuent ailleurs en France : après Roscoff, Rennes ou Lyon, ils arriveront à Nice en mars !


Il n'y a pas de JeBiF Pub dans votre ville ? N'hésitez pas à nous contacter.

Formations/emplois

Des CDI sur les pistes de ski !

Les vacances d'hiver sont là et à défaut de neige, nous avons eu droit à une avalanche de CDI dernièrement !

On se souvient de la première salve de 10 CDI à l'Institut Pasteur de Paris l'année dernière, suivi du recrutement de plusieurs chefs de groupes faisant suite à l'arrivée d'Olivier Gascuel à l'Institut. Eh bien ils ont remis ça, et c'est à nouveau 10 postes qui ont été ouverts en ce début d'année. On croise les doigts pour vous si vous faites partie des candidats ! Il se murmurerait même que... "et c'est pas fini !". A suivre donc.

Du côté de Lyon, c'est le récent Institut de Technologie en Microbiologie BIOASTER qui propose pas moins de 4 CDI en bioinformatique en ce début d'année 2016.

Espérons que cela donne des idées aux autres acteurs de la bioinformatique ancrés dans le paysage français.

On vous rappelle d'ailleurs qu'un petit guide existe pour se préparer pour un entretien d'embauche en bioinfo, il est disponible ici.

Bonne lecture enneigée.

J'ai lu

Débat journalistes/scientifiques, licences et strips

L'année 2016 commence à fond les ballons !

À la suite de la découverte d'un de nos confrères scientifique toulousain (Aurélien Bancaud) c'est toute la presse francophone qui s'est affolée autour de cela. "Très bien !" nous direz-vous, ils parlent de science dans leurs journaux grand public c'est génial. Mais si seulement... En effet, en voulant trop vulgariser, il arrive qu'on en vienne à dire n'importe quoi. Et c'est malheureusement ce qui s'est passé ici, et la nouvelle a été largement reprise et réécrite aux 6 coins de l'hexagone avec à chaque fois les mêmes erreurs grossières répétées inlassablement. Le point positif de l'histoire : un article de réaction a été publié. Il sert actuellement de point de débat entre journalistes, scientifiques et journalistes-scientifiques. Et vous, qu'en pensez-vous ? N'hésitez pas à réagir.

Autre point chaud du moment, les licences. Vous êtes-vous déjà posé la question au moment de publier un bout de code, un programme informatique ou une découverte majeure s'il serait préférable de lui attribuer une licence particulière par rapport à une autre ? Si ça peut vous aider, on essaye de vous aiguiller dans cet article.

Et puis, si jamais vous aviez à présenter ce nouveau programme révolutionnaire à la communauté, il vous faudrait un support de présentation ! Mais vous êtes las des présentations en LaTeX ou du traditionnel ppt... Voici Sozi et un tutoriel d'approche. A vous de le dompter et de passionner votre audience !

Enfin, pour finir sur une note de douceur, voici plusieurs strips BD autour des thèmes de notre quotidien de bioinformaticien(ne)s : la légendaire collaboration bioinfo/biologiste, les clichés des différences entre le public et le privé ou encore en cette période de début de stages la confiance qu'il faudra accorder à vos petits protégés...ou pas :-)

Bonnes découvertes !

À l'affiche...

Ce printemps 2016

Comme à notre habitude voici une sélection des évènements à ne pas manquer dans les mois à venir:

Quelques colloques qui vous donneront l'occasion de voyager

  • Du 4 au 6 avril : le 8ème BICoP (internationale conference on BIoinformatics and Computational Biology), qui aura lieu à Las Vegas. Cette conférence cible les domaines de la bioinformatique, biologie des systèmes, informatique médicale mais aussi les biostatistiques, le bio-data mining, le text mining, la visualisation etc. 
  • Du 20 au 22 avril : le 4ème IWBBIO (International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering) qui aura lieu à Grenade en Espagne. Cette conférence concerne entre autre les projets liés à la protéomique, le NGS, la biomédecine, l'ingénierie biomédicale, la E-santé etc.
  • Du 6 au 9 juin : le Provenance Week 2016 aura lieu à Washington. Cette année, deux conférences seront co-organisées lors de cet évènement : le 6ème IPAW (International Provenance & Annotation Workshop) et le 8ème TaPP (USENIX Workshop on the Theory and Practice of Provenance. Ensemble, l'IPAW et le TaPP regroupent des domaines tels le web sémantique, les bases de données, les opérateurs systèmes, les workflow, etc.
  • Du 28 au 30 juin : l'édition 2016 de JOBIM (Journées Ouvertes de la Biologie Informatique et des Mathématiques), qui aura lieu à Lyon, mais ça, vous l'avez déjà tous noté dans vos agendas :)

Sans oublier quelques formations en France 

Fin mars est riche en formations! Toutes les formations et colloques sont sur le site de la SFBI!

Exclusivité!

BioInfuse : le concours de création de vidéos de vulgarisation de la bioinfo

Des vidéos de vulgarisation scientifique il y en a plein sur Youtube. On pense par exemple à Dirty Biology, à e-penser, ou à Docteur A, etc.

Mais rares sont les vidéos à traiter de la bioinformatique.

C'est pour combler ce manque que l'association des Jeunes Bioinformaticiens de France lance BioInfuse. BioInfuse, c'est un concours de création de vidéos courtes pour vulgariser la bioinformatique.

Comme il s'agit d'un concours, il y aura un gagnant. Et sa vidéo sera diffusée en session plénière lors de JOBIM 2016 à Lyon !

Ça vous intéresse et vous voulez tout savoir à ce sujet ? Rendez-vous sur notre site !

 

 

Exclusivité!

JOBIM 2016 : journée JeBiF et hébergement

Lentement mais sûrement, les jours défilent et nous rapprochent de JOBIM (les Journées Ouvertes en Biologie Informatique et Mathématiques, conférence annuelle sous l'égide de la SFBI). La 17e édition de cette conférence se déroulera du 28 au 30 juin, au campus de l'ENS de Lyon.


Comme pour les années précédentes, l'association JeBiF organise une journée de présentations et d'échanges autour de la bioinformatique. Cette journée aura lieu le lundi 27 juin 2016 à l'IBCP de Lyon. Nouveauté de cette année, la journée se finira par un keynote. Nous aurons donc le plaisir d'écouter François Képès, directeur de recherche CNRS au génopôle d'Evry, avant le traditionnel social event. Pour connaître le programme, rendez-vous sur notre site.

Autre point important : un autre événement de taille a lieu en juin à Lyon cette année : les matchs de football de l'UEFA euro 2016. Une des conséquences de cet événement est le prix élevé des logements. JeBiF invite donc les bioinformaticiens Lyonnais (s'ils le peuvent) à accueillir leurs collègues non-Lyonnais qui auraient des difficultés à se loger. Pour proposer un hébergement, rendez-vous ici.